R 语言数据分析实战

作者

黄湘云

发布日期

2023年10月8日

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Book in early development. Planned release in 2024.

本书初稿是在 RStudio IDE 内使用 Quarto 编辑的,Quarto 是继R Markdown之后,一个新的开源的科学和技术发布系统,它基于 Pandoc支持输出多种格式的书稿,比如 HTML 网页、EPUB 电子书、DOCX 文档和 PDF 便携式文档等。Quarto 吸收了过去 10 年 R Markdown 取得的经验和教训,在书籍写作、创建博客、制作简历和幻灯片等系列场景中支持更加统一的使用语法,一份源文档输出多种格式,使文档内容在不同场景中的迁移成本更低。了解更多 Quarto 特性,请访问 https://quarto.org/

书中的代码字体采用美观的 Source Code Pro 字体, 为方便跨操作系统编译书籍电子版,正文的中文字体采用开源的 fandol 字体。此外,考虑到美观性,本书图形使用了 Noto 系列中英文字体,它们来自 Google Fonts 字体库,分别是 Noto Sans 无衬线英文字体和 Noto Serif SC 宋体中文字体。

书中 R 包名以粗体表示,如 knitr 包,函数名以等宽体表示,如 plot(),函数的参数名同理。代码块内注释用 # 表示,运行结果每一行开头以 #> 标记。本书写作过程中,依赖 knitr (Xie 2015)ggplot2 (Wickham 2016)lattice (Sarkar 2008) 等众多 R 包。考虑到要同时支持 DOCX、EPUB、PDF 和 HTML 四种书籍格式,书中使用 knitr 包和 gt 包制作静态的表格。

为方便测试贡献者提供的 PR,本书托管在 Github 上,同时启用 Github Action 服务,为书籍自定义了一个可复现全书内容的运行环境,包括 R 软件、扩展包和系统软件依赖,详见仓库中的 DESCRIPTION 文件。你现在看到的是在线编译版本,最新一次编译时间是 2023-10-08 13:14:11。

xfun::session_info(packages = c(
  "ggplot2", "gganimate", "ggrepel", "ggraph",
  "ggridges", "ggsignif", "ggforce", "ggdensity",
  "ggbeeswarm", "ggeffects", "ggnewscale",
  "patchwork", "plotly", "lattice", "DT",
  "dplyr", "purrr", "tidyr", "data.table",
  "rsconnect", "knitr", "rmarkdown", "gt", 
  "glmnet", "lme4", "xgboost", "spaMM",
  "sf", "stars", "terra", "INLA", "cmdstanr",
  "showtext", "gifski", "tinytex", "magick"
), dependencies = FALSE)
#> R version 4.3.1 (2023-06-16)
#> Platform: x86_64-redhat-linux-gnu (64-bit)
#> Running under: Fedora Linux 38 (Container Image)
#> 
#> 
#> Locale:
#>   LC_CTYPE=en_US.UTF-8       LC_NUMERIC=C              
#>   LC_TIME=en_US.UTF-8        LC_COLLATE=en_US.UTF-8    
#>   LC_MONETARY=en_US.UTF-8    LC_MESSAGES=en_US.UTF-8   
#>   LC_PAPER=en_US.UTF-8       LC_NAME=C                 
#>   LC_ADDRESS=C               LC_TELEPHONE=C            
#>   LC_MEASUREMENT=en_US.UTF-8 LC_IDENTIFICATION=C       
#> 
#> time zone: UTC
#> tzcode source: system (glibc)
#> 
#> Package version:
#>   cmdstanr_0.6.1    data.table_1.14.8 dplyr_1.1.3       DT_0.30          
#>   gganimate_1.0.8   ggbeeswarm_0.7.2  ggdensity_1.0.0   ggeffects_1.3.1  
#>   ggforce_0.4.1     ggnewscale_0.4.9  ggplot2_3.4.3     ggraph_2.1.0     
#>   ggrepel_0.9.3     ggridges_0.5.4    ggsignif_0.6.4    gifski_1.12.0.2  
#>   glmnet_4.1.8      gt_0.10.0         INLA_23.9.9       knitr_1.44       
#>   lattice_0.21.9    lme4_1.1.34       magick_2.8.0      patchwork_1.1.3  
#>   plotly_4.10.2     purrr_1.0.2       rmarkdown_2.25    rsconnect_1.1.1  
#>   sf_1.0.14         showtext_0.9.6    spaMM_4.4.0       stars_0.6.4      
#>   terra_1.7.46      tidyr_1.3.0       tinytex_0.47      xgboost_1.7.5.1  
#> 
#> Pandoc version: 3.1.8
#> 
#> LaTeX version used: 
#>   TeX Live 2022 with tlmgr 2022-04-18